El Programa de Maestría en Ingeniería que oferta la Escuela de Sistemas Biológicos e Innovación Tecnológica de la Universidad Autónoma Benito Juárez de Oaxaca tiene por misión formar investigadores en las áreas de Sistemas Inteligentes y Nuevas Tecnologías, así como en Materiales Avanzados, que contribuyen en la solución de problemas tecnológicos, la generación y aplicación de conocimientos que alientan el desarrollo tecnológico del estado de Oaxaca, mediante una planta docente interdisciplinaria y un plan de estudios flexible.